我所農田分子生態學科組在東北稻田噬藻體基因多樣性取得新進展
噬藻體是侵染藍藻的細菌病毒，在調控藍藻豐度、多樣性及群落結構演替、生物地球化學循環方面起到重要作用，是一種不可忽視的戰略生物資源。盡管噬藻體在自然環境中廣泛存在，但對其遺傳基因多樣性研究一直滯后。近年來，海洋、湖泊等水生環境中病毒生態學研究在國際上進展迅速，相繼發現一些標記基因可用于解析水生環境中不同類群噬菌體基因多樣性，其中g20基因（編碼噬藻體殼組裝蛋白基因）被廣泛用于研究環境中的噬藻體基因多樣性。
我所農田分子生態學科組前期研究結果發現，我國東北稻田T4型噬菌體g23基因（編碼主要殼蛋白基因）分布與日本稻田存在一定的差異，兩國間各有一些特殊的類群被發現；同時也發現，基于g23基因群集表征的T4型噬菌體群落結構在稻田、海洋和湖泊環境中明顯不同，據此認為T4型噬菌體群落結構分布受到地理環境和生態過程的雙重影響，而對于其它噬菌體遺傳基因的分布是否也具有相似的規律還未明晰。為此，東北地理與農業生態研究所的博士研究生荊瑞勇在王光華研究員指導下，對東北5個樣點的稻田田面水中噬藻體g20基因分布規律進行了調查。研究結果發現，我國東北稻田水體存在3個新的g20基因類群（PFW-VII~-IX）；采用UniFrac方法分析噬藻體g20基因群集發現，噬藻體群落結構在海洋、湖泊及稻田環境中存在顯著的差異（圖1），即使在相同的稻田水體環境中，我國東北稻田水體和日本稻田水體中的噬藻體群落結構也不同（圖2）。該研究結果進一步證明了噬藻體g20基因分布也受到地理環境和生態過程的影響。
該研究得到國家自然科學基金的資助，研究成果近期發表在PLoS ONE上。
Jing R, Liu J, Yu Z, Liu X, Wang G (2014) Phylogenetic distribution of the capsid assembly protein gene (g20) of cyanophage in paddy floodwaters in Northeast China. PLOS One 9:e88634.
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