我所在大豆基因遺傳定位方法研究上取得進展
由于大豆基因組大和基因組復雜,大豆重要農藝性狀基因的定位克隆一直是大豆分子遺傳學研究中的難點。我所大豆功能基因組學學科組的研究人員通過與山東師范大學、中科院上海生命科學研究院和中山大學等科研單位的合作,建立了利用全基因組測序信息開發INDEL分子標記快速定位大豆基因的新方法。
研究組成員通過對大豆“菏豆12”品種的全基因組重測序,獲得了與“Willams82”品種存在差異的49,276個INDEL分子標記和242,059個SNP分子標記。通過對其中243個INDEL分子標記的實驗驗證,建立了165個INDEL分子標記大豆分子標記物理圖譜。利用該圖譜和進一步開發的INDEL分子標記成功地將大豆葉皺突變體定位到了360Kbp的關聯區間。本研究為大豆重要農藝性狀基因克隆和分子輔助育種等研究提供了重要的研究手段。

大豆INDEL分子標記物理圖譜
本研究成果10月19日在G3:Genes|Genomes|Genetics雜志上在線發表。我所大豆分子設計育種重點實驗室的合作培養博士生宋曉峰和我所魏海超博士為論文共同第一作者、馮獻忠研究員和張慧教授為論文責任作者。本研究得到國家自然科學基金的資助。
論文信息:Xiaofeng Song, Haichao Wei, Wen Cheng, Suxin Yang, Yanxiu Zhao, Xuan Li, Da Luo, Hui Zhang, Xianzhong Feng . Development of INDEL Markers for Genetic Mapping Based on Whole-Genome Re-sequencing in Soybean。
論文連接:
http://www.g3journal.org/content/early/2015/10/13/g3.115.022780.full.pdf+html
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